Nacido en Lydda (actual Lod), Habash fue expulsado de su ciudad natal tras la derrota de los palestinos en 1948. Se licenció en medicina por la Universidad de Beirut en 1951, casi al mismo tiempo que se formó el Movimiento de los Nacionalistas Árabes -su lema era ‘unidad, libertad, venganza’-, cuyo ánimo expreso era vengar las pérdidas territoriales sufridas por los palestinos a manos de los israelíes. Inicialmente fue un panarabista comprometido y partidario del presidente de Egipto, Gamal Abdel Nasser, pero evolucionó hacia una postura política más radical. Tras comprobar la imposibilidad de alcanzar la unidad árabe aunque se derrotara a Israel, adoptó una política de ‘guerra popular’.
Tras la guerra de los Seis Días de 1967 Habash fundó el Frente Popular para la Liberación de Palestina, del que fue su presidente. La dura postura de Habash lo implicó en varios secuestros durante la década de 1970.
Posteriormente aumentó los objetivos de su lucha incluyendo a los Estados árabes supuestamente reaccionarios, perpetuando su oposición a Yasser Arafat y a la Organización para la Liberación de Palestina (OLP).
George Habash y la dirección de su partido rechazan parte sustancial de los acuerdos de paz obtenidos con Israel en 1995, desde su sede en Damasco; aunque en abril del año siguiente el Frente Popular votó a favor de la reforma de la Carta (Constitución) palestina propuesta por Arafat.
En 1980 Habash quedó parcialmente paralizado debido a errores cometidos durante una cirurgía cerebral.
Durante la década de 1990 el Frente Popular perdió terreno de cada a la aparición de movimientos de matriz religiosa como Hamas o la Jihad Islámica.
Debido a sus problemas de salud, Habash se retiró de la vida pública, dimitiendo en el 2000 al liderazgo del Frente Popular. Fue sustituido por Abu Alí Mustafá, quien había sido su lugarteniente durante 15 años y que resultó asesinado por las fuerzas israelíes en agosto de 2001, en su oficina de Ramallah.
Habash, que también fue conocido por el seudónimo de Al Hakim (El sabio), murió en Amman, Jordania, el 26 de enero de 2008, de un ataque cardíaco.