Nacido el 8 de septiembre de 1944 en Batna (Argelia), Ali Benflis procede de una familia de revolucionarios, hijo y hermano de mártires de la lucha contra la colonización francesa.
Concluyó una licenciatura en derecho en 1968, y enseguida inició su carrera de magistrado, ocupando el lugar de juez en el Tribunal de Blida en octubre de 1968 y poco después de magistrado en la Administración Central del Ministerio da Justicia, donde ejerció funciones de subdirector del área de delincuencia juvenil.
Fue procurador de la república en Batna de 1969 a 1971, antes de convertirse en procurador general en el tribanal de Constantine de 1971 a 1974, fecha en que optó por una carrera liberal y se instaló como abogado en Batna. Fue miembro del Comité Ejecutivo del Consejo Nacional de Abogados.
Em 1988, fue nombrado ministro de Justicia, cargo que ocupó durante tres gobiernos, hasta renunciar en 1991. Retornó entonces a su profesión de abogado hasta 1997, fecha de su elección para a Asamblea Popular Nacional (Parlamento).
En el plano político, fue elegido en 1989 para el Comité Central y luego para el uró polítio del Frente de Liberación Nacional (FLN), partido en el que sigue militando.
Encabezó la lista del FLN de Batna en las elecciones legistavidas de 1997, que obtuvo tres bancas.
El presidente Abdelaziz Bouteflika le confió la dirección de su campaña a la presidencia en 1999. Tras su elección, Bouteflika lo nombró secretario general de la Presidencia y posteriormente jefe de su gobierno.